Szkoła powstała w 1951 roku przy Zakładach Przemysłu Gumowego Dębica jako Zasadnicza Szkoła Zawodowa Przemysłu Chemicznego. Pierwszym dyrektorem był Jan Ptak, po nim Ludwik Patro, a od roku szkolnego 1951/1952 Stanisław Kruczek.
Nabór pierwszych uczniów był trudny. Po wojnie dał się zauważyć niż demograficzny, a w środowisku brak było tradycji oponiarskich. Do pierwszej klasy zapisały się tylko cztery osoby, co nie pozwalało na rozpoczęcie zajęć. Wtedy Stanisław Kruczek przeprowadził akcję promocyjną w wiejskich szkołach powiatu dębickiego. Okazało się to na tyle skuteczne, że szybko skompletowano całą, ponad 30-osobową klasę. Najwięcej uczniów pochodziło z Braciejowej, Gumnisk i Głobikowej.
Początkowo szkoła mieściła się w zakładowej świetlicy. Brakowało sal lekcyjnych, laboratorium i warsztatów.
W roku 1952 mury szkoły opuścili pierwsi absolwenci, którzy zdobyli zawód: aparatowy przemysłu gumowego. Niemal wszyscy wzmocnili kadrę produkcyjną fabryki. Spora grupa przez wiele lat pracowała na różnych stanowiskach w firmie, m.in.: Leszek Ciołczyk, Marian Dybowski, Aleksander Dziurgot, Józef Kliś, Władysław Grych, Włodzimierz Stec, Antoni Sroka, Marian Skóra, Władysław Mądro, Teresa Matuszkiewicz, Ryszard Mądro, Józef Nawrot, Antoni Pociask, Adolf Sikora, Włodzimierz Stec, Eugeniusz Szumański, Elżbieta Lis, Zofia Bartuś, Franciszek Głowacki, Kazimierz Drobot, Tadeusz Jamróz, Stefan Rusin i Józef Skarbek.
W 1952 roku szkoła przeniosła się do wyremontowanego obiektu. W nowym roku szkolnym chęć nauki w niej deklarowało więcej uczniów, niż było miejsc.
W roku 1953, w związku z rozbudową zakładu, wzrosło zapotrzebowanie na wykwalifikowanych robotników. W nowym roku szkolnym utworzono więc nie jedną, a trzy klasy pierwsze; jedna z nich miała nową specjalizację – ślusarz remontu urządzeń przemysłu chemicznego. Zajęcia odbywały się w jednym z baraków wewnątrz zakładu. Później, od 1956 roku, szkoła znalazła nową siedzibę w budynku Szkoły Mechanicznej przy ul. Rzeszowskiej.
W roku 1965 zorganizowano 5-letnie Technikum Chemiczne. W pierwszym roku do pierwszej klasy technikum przyjęto 40 uczniów. Po pięciu latach nauki 30 z nich zdało egzamin dojrzałości, 8 osób kontynuowało naukę na studiach wyższych. Była to pierwsza, techniczna szkoła średnia w Dębicy.
Warunki nauczania były trudne, program wymagał pięciu laboratoriów, szkoła dysponowała tylko dwoma pomieszczeniami na ten cel.
W latach 60-tych na terenie zakładu zbudowano nowe obiekty szkolne, w których placówka ta funkcjonowała do początku lat 80-tych.
Jeszcze w latach siedemdziesiątych przyzakładową szkołę przekształcono w Zespół Szkół Zawodowych, w ramach którego kształcono młodzież w klasach zawodowych, liceach i technikach. Funkcjonowały także wieczorowe szkoły dla dorosłych, gdzie nauczanie prowadzono w systemie zaocznym. Jej dyrektorem był wówczas Jan Bryniarski. W 1986 roku funkcję tę powierzono Alinie Szydło.
W roku 1983 szkoła otrzymała nowy obiekt w parku, obok biurowca przy ulicy 1 Maja, gdzie prowadzono nauczanie w nowocześnie wyposażonych pracowniach. Uroczyste oddanie budynku do użytku odbyło się 3 września 1983 roku. Nieco później, obok niej, powstały warsztaty praktycznej nauki zawodu (1986). Średnio każdego roku uczyło się w niej wtedy ok. 500 uczniów.
W roku 1986 ZSZ otrzymał imię Eugeniusza Kwiatkowskiego, twórcy Centralnego Okręgu Przemysłowego.
W tym samym roku kierownictwo Stomilu podjęło decyzję o budowie nowego obiektu szkolnego wraz z warsztatami. Po wytyczeniu lokalizacji przy ul. Lisa, obok Zakładowego Domu Kultury, przystąpiono do prac. W ciągu trzech lat wybudowano budynek szkolny oraz przyległe do niego warsztaty. W planach była także budowa sali gimnastycznej i internatu, ale niestety, nie udało się tego zrealizować.
Oddanie nowej siedziby szkoły do użytku odbyło się 19 lutego 1990 roku. W obiekcie o przestronnym i funkcjonalnym układzie wnętrz znajduje się 16 pracowni i gabinetów specjalistycznych, biblioteka z czytelnią, gabinety lekarskie i zaplecze administracyjno-techniczne.
W latach 1990-2007 dyrektorem szkoły była Maria Auguścik. Od 2007 jest nią Joanna Dymitrowska.
Od 1996 roku szkoła ma nowy sztandar, zaprojektowany przez swą ówczesną uczennicę Mariolę Bochnowską.
Obecnie (2024) ZS nr 2 obejmuje:
- III Liceum Ogólnokształcące w Dębicy z podziałem na dwa rozszerzenia: matematyka, informatyka, fizyka oraz matematyka, biologia, chemia;
- Technikum nr 2 w Dębicy: technik informatyk, technik elektronik, technik elektryk, technik teleinformatyk, technik automatyk.
W szkole uczy się ok. tysiąca uczniów.